載脂蛋白分離純化后,獲得了所需要的純品,該純品純度及其品種可通過下述方法進(jìn)行鑒定。
一、免疫電泳法
免疫電泳法既可用于鑒定蛋白種類,又可鑒定其純度。
制備1%的瓊脂糖,以0.1mmol/L巴比妥緩沖液(0.05μ,pH8.6)為溶劑,制作一塊約7×4cm的大小,厚度為0.2~0.3cm的瓊脂糖凝膠,以玻璃板或薄膜為支持物,于凝膠正中打孔(直徑0.2cm)。1孔加全血清5μl,2孔(中間孔)加純化的某產(chǎn)品,3孔加已知某載脂蛋白。電泳電極液為0.05μ,pH8.6的巴比妥緩沖液。當(dāng)標(biāo)本前沿泳動(dòng)到距離凝膠端1cm左右,停止電泳,取出凝膠板,在凝膠板三孔之間開兩條寬0.2cm,長5~5.5cm長的凝膠槽。1與2孔之間的凝膠槽(A槽)中加入羊抗人全血清抗體,2與3孔之間的凝膠槽(B槽)加入羊抗人某Apo單價(jià)特異抗血清,將凝膠板置于含少量水的大平皿中,加蓋,水平置于37℃培養(yǎng)箱24h,再觀察弧形白色沉淀線,與A槽沉淀線位置比較若位置完全相同,初步可以確認(rèn)為2孔純化產(chǎn)品與3孔標(biāo)準(zhǔn)蛋白是同一蛋白質(zhì),如圖17-7所示。
圖17-7 免疫電泳圖(瓊脂糖凝膠)
A:1、2、3分別為抗人ApoAⅠ血清(第一化學(xué))、抗人全血清,抗人ApoAⅠ血清(自制);a、b、c、d分別為ApoAⅠ純品(純化產(chǎn)品)、人血清、人血清、ApoAⅠ純品(sigma)
B:1、2分別為抗人全血清,抗有ApoB血清(自制):a、b、c分別為人血清、人血清和人ApoB純品(自制)
二、免疫火箭電泳
按本章節(jié)的方法進(jìn)行操作,若為單一火箭沉淀峰,也可判純化產(chǎn)品為單一蛋白,如圖17-8所示。
三、免疫雙擴(kuò)散法
制備1%瓊脂糖凝膠(0.05μ,pH8.6的巴比妥緩沖液為溶劑),按圖打孔。圖17-9中孔加入已知某Apo單價(jià)特異羊抗人血清,周邊第1孔加純化產(chǎn)品,第2孔加已知某Apo純品,置37℃培養(yǎng)箱24h,若第1與2孔旁兩條白色沉淀線相互融成一個(gè)弧形,無分叉,表明1孔與2孔的蛋白質(zhì)與中孔抗血清的抗有相同的抗原性,可確認(rèn)為同一蛋白質(zhì)。
17-8 免疫火箭電泳圖
A:瓊脂糖凝膠板含抗人全血清、抗原孔含人ApoAⅠ純品;
B:瓊脂糖凝膠析含抗人全血清、抗原孔含人ApoB純品。
圖17-9 各種抗原抗體系的沉降線示意圖
1,2:同一抗原抗體系(complete identity)
3f1411.cn/zhuyuan/:不同的抗原抗體系(nonientity)
4:部分相同的抗原抗體系(partialidentity)
四、等電聚焦電泳
利用IEF-PAGE測(cè)等電點(diǎn),根據(jù)等電點(diǎn)確認(rèn)蛋白質(zhì)性質(zhì)。
五、蛋白質(zhì)分子量測(cè)定
從化學(xué)觀點(diǎn)考慮,分子量是組成蛋白質(zhì)分子的各原子量總和。但是,對(duì)大分子的蛋白質(zhì)來講,若不知道分子量也無法得知每個(gè)分子的元素組成情況。為此,人們?cè)诘鞍踪|(zhì)的研究中,對(duì)測(cè)定其分子量工作極為重視,先后用于測(cè)定蛋白質(zhì)分子量的方法有滲透壓、粘度、光散射、蛋白質(zhì)氨基酸序列分析法、超速離心(沉降速度或沉降平衡)、凝膠層析和SDS-PAGE等法。載脂蛋白分子量測(cè)定多采用超速離心沉降速度法、凝膠層析法和SDS-PAGE法。
凝膠法層析用:1gM=A-B(Ve/Vo)
SDS-PAGE用:lgM=A-BRf
式中,對(duì)已知標(biāo)準(zhǔn)樣品,x和y分別為實(shí)驗(yàn)值和已知值。n是實(shí)驗(yàn)的點(diǎn)數(shù)。采用上述兩個(gè)方程,由已知樣品的數(shù)據(jù),可以求出標(biāo)準(zhǔn)線的兩個(gè)常數(shù)A、B值。對(duì)未知樣品,只要測(cè)出x,利用A、B值可以計(jì)算出y值?傊瑥膶(shí)驗(yàn)測(cè)得的數(shù)據(jù)計(jì)算該實(shí)驗(yàn)方法所用方程的常數(shù),再用這個(gè)常數(shù)計(jì)算出未知樣品的分子量,所得結(jié)果比作圖法精確,且很方便。
下文僅介紹SDS-PAGE作圖法測(cè)定蛋白質(zhì)的分子量。
十二烷基磺酸鈉(sodium dodecyl sulfate,SDS)是一種陰離子去污劑,于100℃加熱,在β-巰基乙醇存在下,可以使大多數(shù)多聚體蛋白質(zhì)的四級(jí)結(jié)構(gòu)解體,并與各亞基牢固地結(jié)合,從而遮蔽了蛋白質(zhì)分子上原有電荷,同時(shí)帶上強(qiáng)的負(fù)電荷。
由于所有的SDS-蛋白質(zhì)復(fù)合物(圖17-10),在電泳時(shí)都以同樣的電荷按分子量大小不同向正極移動(dòng),作SDS聚丙烯酰胺凝膠泳動(dòng)(SDS-PAGE)時(shí),其泳動(dòng)速度僅決定于蛋白質(zhì)的分子量。SDS與蛋白質(zhì)的結(jié)合是成比例的,所以SDS-蛋白質(zhì)復(fù)合物在泳動(dòng)中的不同速率,就反映了分子量的不同。與分子量的對(duì)數(shù)和相對(duì)遷移率成一定比例關(guān)系。使用已知分子量的標(biāo)準(zhǔn)物作標(biāo)準(zhǔn)曲線(圖17-11,圖17-12)或用計(jì)算法確定標(biāo)準(zhǔn)曲線的常數(shù),即可求出未知樣品的分子量。用這種方法測(cè)定的分子量是亞單位肽鏈的分子量。
圖17-10 SDS對(duì)蛋白質(zhì)四級(jí)結(jié)構(gòu)的破壞作用,SDS與亞基牢固地結(jié)合,遮蔽了蛋白分子的原有電荷
實(shí)驗(yàn)結(jié)果也可以通過公式運(yùn)算求蛋白質(zhì)分子量:
先求得遷移率Rf,Rf=de/do
de為樣品遷移距離,do為前沿遷移距離(染料)
從幾種標(biāo)準(zhǔn)樣品的Rf值和分子量對(duì)數(shù),用最小二乘法能準(zhǔn)確地求得a、b二常數(shù),從而可進(jìn)行未知物分子量的計(jì)算。
圖17-11 人ApoAⅠ分子量測(cè)定圖(SDS-PAGE)
圖17-12標(biāo)準(zhǔn)蛋白質(zhì)分子量測(cè)曲線(SDS-PAGE)
1為蛋白質(zhì)標(biāo)準(zhǔn)分子量(LKB):
2為ApoAⅠ純品(Sigma);
3為ApoAⅠ純品(自制)
SDS-PAGE的分子量測(cè)定簡要步驟是:①制備4%~30%的聚丙烯酰胺梯度凝膠;②待測(cè)蛋白純品和標(biāo)準(zhǔn)分子量標(biāo)本的制備,按蛋白樣品1mg/ml濃度溶于含有20%蔗糖的電極緩沖液中,加入5μl0.1%溴酚蘭作指示染料,取50μl上樣;③電泳:電極緩沖液(有多種),含1%SDS;④染色脫色:考馬斯亮蘭R-25f1411.cn/job/0染色,脫色;⑤制作標(biāo)準(zhǔn)分子量曲線;量取從原點(diǎn)到前沿溴酚蘭及原點(diǎn)至各條蛋白區(qū)域的距離。計(jì)算各自標(biāo)準(zhǔn)蛋白的Rf值,以LogMW對(duì)相應(yīng)的Rf作圖,繪成標(biāo)準(zhǔn)分子量蛋白曲線如圖17-8、圖17-9所示,以待測(cè)蛋白質(zhì)的Rf值在標(biāo)準(zhǔn)曲線上得到LgMW值,計(jì)算待測(cè)Apo純品的分子量。
測(cè)定分子量的SDS-PAGE法主要優(yōu)點(diǎn)是快速,樣品用量少,可同時(shí)測(cè)定幾個(gè)樣品。缺點(diǎn)是誤差較大,誤差主要與電泳蛋白區(qū)域移動(dòng)距離測(cè)量是否有關(guān)。
SDS-PAGE法測(cè)定的是亞單位肽鏈的分子量。常用的標(biāo)準(zhǔn)蛋白質(zhì)如表17-1所示。
表17-1 標(biāo)準(zhǔn)蛋白質(zhì)及其分子量
名 稱 | 分 子 量 | 名 稱 | 分 子 量 |
細(xì)胞色素C | 11700 | 過氧化氫酶(單體) | 60000 |
核糖核酸酶 | 13700 | 牛血清白蛋白(單體) | 68000 |
肌紅蛋白 | 17200 | 乳酸脫氫酶(單體) | 36000 |
胰凝乳蛋白酶原 | 25700 | 乳酸脫氫酶 | 130000 |
胰蛋白酶 | 23300 | β-淀粉酶 | 215000 |
羧肽酶A | 34600 | 過氧化氫酶 | 240000 |
胃蛋白酶 | 35000 | 黃嘌呤氧化酶 | 275000 |
卵清白蛋白 | 45000 | 脲酶 | 483000 |
六、雙相電泳
血漿或組織中有成千累萬種蛋白質(zhì),等電點(diǎn)近似,分子量大小類同的蛋白質(zhì)很多,若僅單一測(cè)蛋白質(zhì)的pI或分子量,還不足以說明是某一的蛋白質(zhì),可能是也可能不是。如果既測(cè)定pI,又測(cè)定分子量,利用這兩種參數(shù)鑒定蛋白,其確認(rèn)的準(zhǔn)確率將得到很大的提高,因?yàn)檫@兩種參數(shù)都相同的蛋白質(zhì)的概率是很小的。為此常采用雙相電泳技術(shù)即第一相為IEF-PAGE,另一相為SDS-PAEG,進(jìn)行蛋白質(zhì)的鑒定。
七、蛋白質(zhì)化學(xué)組成分析
末端氨基的分析,是鑒定蛋白質(zhì)純度的方法之一。一條肽鏈的蛋白質(zhì),通過N-末端的定量分析,每克分子蛋白質(zhì)應(yīng)當(dāng)有整數(shù)克分子的N-末端氨基酸,少量其他末端氨基酸的存在,常常表示存在有雜質(zhì)。
分析蛋白質(zhì)各種氨基酸百分比,也可作為蛋白質(zhì)各類鑒定的參考值。
最終的純度標(biāo)準(zhǔn),應(yīng)當(dāng)是氨基酸順序的測(cè)定。