中國(guó)協(xié)和醫(yī)科大學(xué)的前身是“北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院”，由美國(guó)洛克菲勒基金會(huì)于1917年創(chuàng)辦；中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院成立于1956年，是我國(guó)唯一的國(guó)家級(jí)醫(yī)學(xué)科學(xué)學(xué)術(shù)中心和綜合性科學(xué)研究機(jī)構(gòu)。黨中央、國(guó)務(wù)院和國(guó)家歷屆領(lǐng)導(dǎo)人對(duì)中國(guó)協(xié)和醫(yī)科大學(xué)、中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院十分關(guān)心支持，1997年江澤民主席親筆為中國(guó)協(xié)和醫(yī)科大學(xué)題寫(xiě)了“嚴(yán)謹(jǐn)、博精、創(chuàng)新、奉獻(xiàn)”的校訓(xùn)。
中國(guó)協(xié)和醫(yī)科大學(xué)、中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院（簡(jiǎn)稱(chēng)院校)實(shí)行院校合一的管理體制，互相依托，優(yōu)勢(shì)互補(bǔ)，教研相長(zhǎng)。她面向全國(guó)，承擔(dān)著科研、教學(xué)、醫(yī)療三大任務(wù)。
院校的研究生教育始于1954年，截至1965年共招收培養(yǎng)研究生210余人（無(wú)學(xué)位)。1978年院�；謴�(fù)研究生招生，是國(guó)務(wù)院首批批準(zhǔn)可授予博士、碩士學(xué)位的單位，是國(guó)內(nèi)目前唯一一所可授予雙博士學(xué)位（PH.D＆M.D)的學(xué)校，是實(shí)行單獨(dú)考試和招收港、澳、臺(tái)研究生、國(guó)外留學(xué)生的院校之一。隨著研究生教育的迅速發(fā)展，經(jīng)國(guó)務(wù)院批準(zhǔn)，1986年7月正式成立中國(guó)協(xié)和醫(yī)科大學(xué)研究生院，統(tǒng)一領(lǐng)導(dǎo)院校的學(xué)位與研究生教育工作。從此，研究生教育進(jìn)入了一個(gè)新階段，培養(yǎng)基地不斷壯大，院校所屬19個(gè)院所招收培養(yǎng)研究生。經(jīng)過(guò)20多年的建設(shè)與發(fā)展，院校已建成學(xué)科門(mén)類(lèi)較為齊全，指導(dǎo)力量雄厚，科研基礎(chǔ)扎實(shí)的研究生培養(yǎng)基地。1978至2004年9月共招收研究生8438人，其中碩士生5325人，博士生3313人。
學(xué)科齊全，綜合優(yōu)勢(shì)顯著，學(xué)位授權(quán)點(diǎn)和招生專(zhuān)業(yè)覆蓋理學(xué)、工學(xué)、醫(yī)學(xué)、管理學(xué)四個(gè)學(xué)科門(mén)類(lèi)，十個(gè)一級(jí)學(xué)科。擁有基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)、臨床醫(yī)學(xué)、生物學(xué)、藥學(xué)、中西醫(yī)結(jié)合、生物醫(yī)學(xué)工程六個(gè)一級(jí)學(xué)科博士學(xué)位授權(quán)點(diǎn)；博士后科研流動(dòng)站四個(gè)。
院校擁有260多個(gè)實(shí)驗(yàn)室，其中國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室三個(gè)，部委級(jí)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室六個(gè)；國(guó)家重點(diǎn)學(xué)科18個(gè)、北京重點(diǎn)學(xué)科3個(gè)。院校圖書(shū)館藏書(shū)超過(guò)86萬(wàn)冊(cè)，期刊5700余種，被定為國(guó)家級(jí)中心圖書(shū)館和國(guó)家科技圖書(shū)文獻(xiàn)中心醫(yī)學(xué)分中心；醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)檢索中國(guó)中心、WHO衛(wèi)生與生物醫(yī)學(xué)信息合作中心。中國(guó)醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)分析和檢索系統(tǒng)向全國(guó)提供醫(yī)學(xué)信息，并在全國(guó)建立起醫(yī)學(xué)信息網(wǎng)；公開(kāi)發(fā)行期刊23種。“九五”期間承擔(dān)科研項(xiàng)目925項(xiàng)，其中國(guó)家級(jí)重點(diǎn)項(xiàng)目447項(xiàng)；“十五” 初期承擔(dān)科研項(xiàng)目927項(xiàng)，其中國(guó)家級(jí)重點(diǎn)項(xiàng)目465項(xiàng)；有較充足的科研經(jīng)費(fèi)，具備開(kāi)展綜合性研究和尖端性研究的基礎(chǔ)和條件。
有一支強(qiáng)大的指導(dǎo)力量，院校擁有一大批在醫(yī)學(xué)衛(wèi)生領(lǐng)域經(jīng)驗(yàn)豐富、學(xué)術(shù)水平較高并做出杰貢獻(xiàn)的專(zhuān)家、教授。具有高級(jí)職稱(chēng)人員1400多人,其中正高職604名，副高職823名，有兩院院士25人，其中中國(guó)科學(xué)院院士10人，中國(guó)工程院院士15人，博士生指導(dǎo)教師375人；碩士生指導(dǎo)教師542人，國(guó)家級(jí)和部委級(jí)有突出貢獻(xiàn)的中青年專(zhuān)家62人，教育部“長(zhǎng)江學(xué)者獎(jiǎng)勵(lì)計(jì)劃”特聘教授6人，院校特聘教授10人。
院校十分重視國(guó)際科技合作與學(xué)術(shù)交流，已同20多個(gè)國(guó)家（地區(qū))的醫(yī)學(xué)院校和科研機(jī)構(gòu)建立起學(xué)術(shù)交流與科技合作關(guān)系。有200余名國(guó)外專(zhuān)家學(xué)者被授予協(xié)和醫(yī)大名譽(yù)教授或客座教授。經(jīng)國(guó)務(wù)院學(xué)位委員會(huì)批準(zhǔn)，協(xié)和醫(yī)大分別授予馬耳他共和國(guó)前總統(tǒng)文森特.塔博恩、美國(guó)中華醫(yī)學(xué)基金會(huì)前主席布坎南、美國(guó)中華醫(yī)學(xué)基金會(huì)主席徐旺志名譽(yù)博士學(xué)位。自1985年以來(lái)，院校相繼與美國(guó)哈佛大學(xué)醫(yī)學(xué)院、澳大利亞西澳大學(xué)醫(yī)學(xué)院、美國(guó)加州大學(xué)舊金山分校醫(yī)學(xué)院、香港中文大學(xué)醫(yī)學(xué)院、香港大學(xué)醫(yī)學(xué)院及澳門(mén)鏡湖護(hù)理學(xué)院簽訂了校際交流的協(xié)議，彼此交換學(xué)生到對(duì)方學(xué)校進(jìn)行短期臨床訓(xùn)練。院校有九個(gè)世界衛(wèi)生組織合作中心，通過(guò)與世界衛(wèi)生組織的合作與交流，促進(jìn)了科研和研究生教育的發(fā)展。
在研究生招生中不斷調(diào)整層次，逐步擴(kuò)大博士生招生，研究生教育的重點(diǎn)轉(zhuǎn)向以博士生教育為主。建立起醫(yī)學(xué)科學(xué)學(xué)位與醫(yī)學(xué)專(zhuān)業(yè)學(xué)位兩種不同規(guī)格的培養(yǎng)模式。前者以科研能力訓(xùn)練為主，以培養(yǎng)從事科研和教學(xué)工作的高級(jí)專(zhuān)門(mén)人才為目的；后者以臨床實(shí)際工作能力訓(xùn)練為主，以培養(yǎng)臨床高級(jí)專(zhuān)門(mén)人才為目的。
為保證研究生培養(yǎng)質(zhì)量，在研究生完成課程學(xué)習(xí)及選題計(jì)劃，在即將進(jìn)入科研論文實(shí)施階段時(shí)，結(jié)合研究生開(kāi)題報(bào)告對(duì)其進(jìn)行中期考核，由導(dǎo)師和本學(xué)科及相關(guān)學(xué)科的教授、副教授（或相當(dāng)職稱(chēng))3-5人組成考核小組，對(duì)研究生的基礎(chǔ)理論、思想政治品德、專(zhuān)業(yè)、專(zhuān)業(yè)外語(yǔ)、綜述能力等方面進(jìn)行綜合考核，對(duì)碩士生考核優(yōu)秀者可建議轉(zhuǎn)入博士階段，合格者繼續(xù)碩士生培養(yǎng)，不合格者終止學(xué)習(xí)；對(duì)博士生考核合格者繼續(xù)博士生培養(yǎng)，不合格者終止學(xué)習(xí)。并建立了研究生培養(yǎng)質(zhì)量檢查評(píng)估體系，包括：臨床醫(yī)學(xué)博士生培養(yǎng)質(zhì)量檢查評(píng)估；醫(yī)學(xué)科學(xué)學(xué)位研究生科研工作和論文水平評(píng)估等。
二十一世紀(jì)院校教育中、長(zhǎng)期發(fā)展的總體目標(biāo)為：醫(yī)學(xué)教育堅(jiān)持高層次、小規(guī)模辦學(xué)方針，加強(qiáng)博士和博士后人才培養(yǎng)，承擔(dān)起培養(yǎng)一流的醫(yī)學(xué)人才，提供一流科研成果和一流的醫(yī)療服務(wù)的重任。力爭(zhēng)把院校辦成世界知名、全國(guó)一流的醫(yī)學(xué)科學(xué)中心和研究型大學(xué)。根據(jù)這一目標(biāo)，研究生院將在以下幾個(gè)方面努力做好工作：
抓好學(xué)科建設(shè)。學(xué)科建設(shè)是高等院校的根本建設(shè)，是培養(yǎng)人才的園地，它與研究生教育相互依存，密切相關(guān)，學(xué)科建設(shè)向來(lái)是我校的重要工作。
在進(jìn)一步提高碩士生培養(yǎng)質(zhì)量的同時(shí)，要把工作的重點(diǎn)轉(zhuǎn)移到博士生的培養(yǎng)上來(lái)。嚴(yán)格考核和論文答辯制度。醫(yī)學(xué)科學(xué)博士學(xué)位論文要求創(chuàng)新、求實(shí)，與學(xué)位論文內(nèi)容相關(guān)的科研論文要求在SCI檢索的雜志上發(fā)表，其影響因子不同的專(zhuān)業(yè)有不同的要求。繼續(xù)搞好臨床專(zhuān)業(yè)學(xué)位工作，加強(qiáng)臨床能力培養(yǎng)與考核，以造就一支高素質(zhì)的臨床醫(yī)療隊(duì)伍，提高我國(guó)臨床醫(yī)療總體水平。同時(shí)，要不斷提高博士生的政治思想水平和品德修養(yǎng)。
抓好導(dǎo)師隊(duì)伍和管理干部隊(duì)伍建設(shè)，發(fā)揮兩支隊(duì)伍教書(shū)育人、服務(wù)育人、管理育人的作用，培養(yǎng)出合格人才。
