八、光敏2,4-二硝基苯(光敏DNP)標(biāo)記DNA法
光敏DNP由一連接臂組成,一端是2,4-二硝基苯,另一端有芳基疊氮化合物。此法適用于含氨基檢測基團。其敏感性和光敏生物素標(biāo)記探針相同,檢測時需要抗DNP抗體和免疫化學(xué)顯色。標(biāo)記方法:(1)DNA不心變性,必須溶于水中,取2~10μg10μl,加入二甲亞砜25μl,每微克DNA加入光敏DNp 2μg(在避光條件下),混勻。(2)置入冰浴中,在特制燈10cm下照射10min。(3)加入水165μl,4mol/L醋酸鈉20μl和異丙醇50μl,混勻。(4)用705和無水乙醇沉淀各一次,晾干,按50μg/ml溶于200μl水中,如探針不溶時,可在60℃水溶中加熱10min,離心5min,除去不溶性雜質(zhì),分裝,-20℃可保存1~2年。此法簡便,不僅適用于核酸標(biāo)記,也適用于蛋白質(zhì)標(biāo)記。
九、三硝基苯磺酸(TNBS)標(biāo)記核酸探針
在溫和的條件下,TNBS將核酸的胞嘧啶轉(zhuǎn)化為N-甲氧基-5,6-二氫嘧啶-6-磺酸鹽衍生物,對胞嘧啶殘基進行磺化修飾制成磺化半抗原探針。此法十分簡便,也可用于蛋白質(zhì)的標(biāo)記。標(biāo)記方法:取變性單鏈的DNA5μg,溶于0.02mol/L硼酸鈉緩沖液(pH8.6)中,加入TNBS5μg溶解,在室溫中反應(yīng)1h。移入冰浴中,加入無水乙醇和70%乙醇各洗1次,晾干,用50μl消毒雙蒸水溶解,分裝,-20℃保存?zhèn)溆谩?/P>
十、生物素化的RNA探針標(biāo)記
RNA探針比cDNA探針的敏感性提高10倍以上,在許多優(yōu)點。它們是單鏈,不需變性,也沒有互補鏈的干擾,與靶基因雜交比DNA探針更穩(wěn)定。Bio-11-dUTP可通過Sp6、T3和T7RNA聚合酶摻入到RNA轉(zhuǎn)錄子中。標(biāo)記方法:其下列反應(yīng)體積為50μl:40mmol/l Tris HCl pH8.0、8mmol/l MgCl2、2mmol/L亞精胺、25mmol/l NaCl, 1mmol/L每一ATP、GTP、GTP,1mmol/L生物素Bio-11-Dutp,500ng模板,45u T3RNA聚合酶;旌希37℃反應(yīng)1h。加入10%SDS終止反應(yīng)。凝膠過濾分離標(biāo)記RNA探針。
十一、辣根過氧化物酶標(biāo)記核酸探針法
此法標(biāo)記原理如下圖所示:
標(biāo)記的HRP部分催化底物化學(xué)發(fā)光反應(yīng):氨基苯二甲酰肼 氨基苯二甲酸
+N2+光→X-光片上感光10~20min顯定影。
光亮子在酚、萘及胺類等增強劑促進下,而使光亮增強。
這種方法就是利用特殊的酶底物,氧化后把產(chǎn)生的能量轉(zhuǎn)變?yōu)楣饽芊懦,稱為化學(xué)發(fā)光。雜交后與探針結(jié)合的酶催化相應(yīng)的發(fā)光劑,經(jīng)增強劑將光能放大,在X光片上顯示雜交信號。此方法靈敏度與同位素標(biāo)記水平相當(dāng),簡便快速,安全,是一種特異性好的檢測手段,具有廣泛的應(yīng)用前景。
HBV-DNA的HRP標(biāo)記方法:質(zhì)粒中插入HBV全基因組DNA,長3.2kb,載體為PBR322質(zhì)粒,4.3kb。將質(zhì)粒DNA用三蒸水稀釋成10ng/μl,取20μl放入EP管,100℃變性5min,加入20u HRP標(biāo)記試劑,混勻,加入戊二醛20μl混勻,37℃10min,此時可立即使用,或放在冰浴中10~15min內(nèi)使用,或加入50%去離子甘油-20℃保存供分子雜交用,可存放6個月。
十二、用聚合酶鏈反應(yīng)標(biāo)記高活性DNA探針
聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)或稱體外基因倍增技術(shù),它利用一對位于待擴增的DNA序列兩端的取向相對的DNA引物,在DNA聚合酶的介導(dǎo)下,經(jīng)過多次變性,退火和延伸過程的重復(fù)性循環(huán),大量合成靶DNA序列。在標(biāo)記dNTP存在時,經(jīng)PCR反應(yīng)產(chǎn)生的靶DNA片段均參入了標(biāo)記物,用此法標(biāo)記的探針標(biāo)記率高達97.4%。此法重復(fù)性好,簡便、快速、特異、不要求模板DNA的純度,可以大量制備。此法有普遍應(yīng)用價值。
標(biāo)記方法如下:待標(biāo)DNA模板1ng,50mmol/L KCl, 10mmol/L Tris-HCl(pH8.4),2.5mmol/L MgCl2 dATP、dCTP、dGTP各200μmol/l dTTP150μmol/Ll,Bio-11-dUTP 50μmol./L, 引物各1μmol/L,明膠200μg/ml,2u Taq DAN聚合酶,總反應(yīng)體積為100μl;靹蚝螅邮炗头忭,94℃和55℃各2min,72℃3min,經(jīng)25個循環(huán)后,可產(chǎn)生5~10μg標(biāo)記探針,需時僅4h。乙醇沉淀擴增的產(chǎn)物后,溶于100μl TE中,分裝-20℃。