二、噬菌體載體
噬菌體(phage)是感染細(xì)菌的一類病毒,有的噬菌體基因組較大,加入λ噬菌和T噬菌體等;有的則較小,如M13、f1、fd噬菌體等。用感染大腸桿菌的λ噬菌體改造成的載體應(yīng)用最為廣泛。
λ噬菌體由頭和尾構(gòu)成,其基因組是長約49kb的線性雙鏈DNA分子,組裝在頭部蛋白質(zhì)外殼內(nèi)部,其序列已被全部測出。λ噬菌體感染時,通過尾管將基因組DNA注入大腸桿菌,而將其蛋白質(zhì)外殼留在菌外。DNA進入大腸桿菌后以其兩端12bp的互補單鏈粘末端環(huán)化成環(huán)狀雙鏈,可以兩種不同的方式繁殖(圖20-3):①溶菌性方式(lytic pathway):在營養(yǎng)充足,條件適合細(xì)菌繁殖時,利用宿主菌中的酶類和原料,λDNA上基因可按調(diào)控的順序表達合成構(gòu)成噬菌體頭、尾和尾絲所需的各種蛋白質(zhì),λDNA經(jīng)多次復(fù)制合成許多子代λDNA,于是裝配成許多子代的λ噬菌體,最后裂菌,釋放出許多新的λ噬菌體。②溶原性方式(lysogenic pathway):進入細(xì)菌的λDNA可整合(integrate)入細(xì)菌的染色質(zhì)DNA中,隨細(xì)菌染色體DNA復(fù)制,傳給細(xì)菌后代,這個穩(wěn)定潛伏在細(xì)菌染色質(zhì)DNA中的λDNA稱為原噬菌體(prophage),含有原噬菌體的細(xì)菌稱為溶源菌(lysogen)。λDNA的整合是可逆的,原噬菌體可從宿主DNA中切出,進入溶菌性方式的繁殖。
圖20-3 λ噬菌體的溶菌和溶原繁殖方式
λ噬菌體整個基因組如圖20-4所示,可分為三個部分,①左臂:從A到J長約20kb,其中的基因編碼構(gòu)成頭部、尾部、尾絲對組裝完整噬菌體所需要的蛋白質(zhì)。②中段:長約20kb,是λDNA整合和切出,溶原生長所需的序列。③右臂:長約10kb,是調(diào)控區(qū),控制溶菌和溶原生長最重要的調(diào)控基因和序列、以及λDNA復(fù)制起始均在這區(qū)域內(nèi)。左右臂包含λDNA復(fù)制、噬菌體結(jié)構(gòu)蛋白合成、組裝成熟噬菌體、溶菌生長所需全部序列;對溶菌生長來說,中段是非必需的。醫(yī).學(xué) 全在.線,提供www.med126.com
利用λ噬菌體作載體,主要是將外來目的DNA替代或插入中段序列,使其隨左右臂一起包裝成噬菌體,去感染大腸桿菌,并隨噬菌體的溶菌繁殖而繁殖,F(xiàn)在廣泛使用的λ噬菌體載體也是已作過許多人工改造的,主要的改造是:①設(shè)計去除λDNA上的一些限制性酶切點。這是因為λDNA較大,序列中的限制性酶切點過多,妨礙其應(yīng)用。②在中段非必需區(qū),替換插入某些標(biāo)志基因如上述的可供藍白篩選lacI-lacZ’序列,和多克隆位點等。由此可構(gòu)建出兩類λ噬菌體作載體;一類是插入型載體,可將外來序列插中段,常用的λgt系列載體,一般容許插入5-7kb外來DNA;另一類是轉(zhuǎn)換型載體,即可用外來DNA替代中段,如IMBL系列載體。
圖20-4 野生型λ噬菌體DNA及相應(yīng)的λ噬菌體DNA圖譜
插入或置換中段外來的DNA長度是有一定限制的,當(dāng)噬菌體DNA長度大于野生型λ噬菌體基因組105%或小于78%時,包裝而成的噬菌體存活力顯著下降。所以λ噬菌體載體可插入長5-20kb的外來DNA,這比質(zhì)粒載體能插入的DNA長得多;而且包裝的λ噬菌體感染大腸桿菌要比質(zhì)粒轉(zhuǎn)化細(xì)菌的效率高得多,所以λ噬菌體載體常用于構(gòu)建cDNA文庫或基因組文庫。但λ噬菌體載體的克隆操作要比質(zhì)粒載體復(fù)雜。
如果將左右臂和中段都去除,僅留下λDNA而端包裝噬菌體所必需的cos序列,再加上質(zhì)粒的復(fù)制序列、標(biāo)志基因、多克隆位點等,就可構(gòu)成cos質(zhì);蚍Q為粘粒的載體。粘粒可插入45kb長的外源DNA,然后用λ噬菌體外殼蛋白包裝成噬菌體,感染大腸桿菌后,粘粒的DNA能以質(zhì)粒的形式在細(xì)菌中繁殖而被克隆。所以粘粒主要用于DNA文庫的構(gòu)建。
三、動物病毒載體
質(zhì)粒和噬菌體載體只能在細(xì)菌中繁殖,不能滿足真核DNA重組需要。感染動物的病毒可改造用作動物細(xì)胞的載體。由于動物細(xì)胞的培養(yǎng)和操作較復(fù)雜、花費也較多,因而病毒載體構(gòu)建時一般都把細(xì)菌質(zhì)粒復(fù)制起始序列放置其中。使載體及其攜帶的外來序列能方便地在細(xì)菌中繁殖和克隆,然后再引入真核細(xì)胞。目前病毒載體常用者有改造來自猴腎病毒SV40(Simian Virus 40)、逆轉(zhuǎn)錄病毒和昆蟲桿狀病毒等,使用這些病毒載體的目的多為將目的基因或序列放入動物細(xì)胞中表達或試驗其功能、或作基因治療等(見后)。
人基因組十分龐大,約含4×109bp,建立和篩選人的基因組文庫,要求有容量更大的載體,酵母人工染色體(yeast artificial chromosome,YAC)載體應(yīng)運而生。YAC含有酵母染色體端粒(telesome)、著絲點(centromere)及復(fù)制起點等功能序列,可插入長度達200-500kb的外源DNA,導(dǎo)入酵母細(xì)胞可以隨細(xì)胞分裂周期復(fù)制繁殖供作克隆,成為人基因組研究計劃的重要工具。