原上海第二醫(yī)科大學與上海交通大學于2005年7月正式合并之后，原上海第二醫(yī)科大學研究生院現(xiàn)已正式更名為上海交通大學研究生院醫(yī)學院分院，全面負責學校醫(yī)學研究生的培養(yǎng)、教育和管理工作。
醫(yī)學院于1955年開始培養(yǎng)研究生，是國內較早招收醫(yī)學研究生的院校之一。 1978年恢復研究生培養(yǎng)制度以后，經過二十多年的努力，醫(yī)學研究生的教育得到了迅速的發(fā)展和長足的進步，辦學規(guī)模不斷擴大，迄今已為國家培養(yǎng)和輸送了4000多名醫(yī)學博士生和醫(yī)學碩士生，已成為在國內具有重要影響的醫(yī)藥衛(wèi)生高層次人才培養(yǎng)的重要基地之一。
在學位授權點方面，醫(yī)學院現(xiàn)擁有基礎醫(yī)學、生物醫(yī)學工程、臨床醫(yī)學、口腔醫(yī)學、生物學等5個一級學科博士學位授權點，51個二級學科博士學位授權點，二級學科碩士學位授權點48個，一級學科博士后流動站4個。根據學科發(fā)展需要，學�？梢砸婪ㄗ灾鳑Q定招生、培養(yǎng)和授予學位；在師資隊伍方面，現(xiàn)有博士生指導教師322名，碩士生指導教師570名。其中包括了一批頗具實力、在學術領域具有相當知名度的頂尖科學家和學科領軍人物。有兩院院士12名，國家“973項目”首席科學家4名，長江學者特聘教授4名，長江學者講座教授1名；在研究生教學、培養(yǎng)基地方面，現(xiàn)擁有14個學院、12所醫(yī)院，22個研究所。在學科建設方面，擁有國家教育部重點學科6個，上海市重點學科11個，上海市醫(yī)學重點學科9個。國家重點實驗室2個，教育部重點實驗室2個，衛(wèi)生部重點實驗室5個，上海市重點實驗室13個。世界衛(wèi)生組織（WHO)合作中心3個，上海市級研究所21個。
為了適應我國社會主義經濟建設和文化發(fā)展的需要，研究生分院目前正圍繞創(chuàng)建世界一流醫(yī)學院的目標，堅持突出“質量”與“創(chuàng)新”兩大主題，繼續(xù)深化改革, 注意吸收先進經驗，力爭在學科建設、學位點數量、培養(yǎng)規(guī)模、培養(yǎng)質量、導師隊伍、管理體制等方面跨上新臺階，使學位與研究生教育達到國內同類大學的前列水平，并成為在國內具有引領作用以及重要影響的醫(yī)學學位與研究生教育基地。
全稱：上海交通大學研究生院醫(yī)學院分院
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