三、電泳分析
在實(shí)際工作中常采用瓊脂糖凝膠電泳。一般情況下先在電泳緩沖液或凝膠中加1%溴化乙錠(EB)(每100ml加100μl),然后將已經(jīng)制備好的1%~2%瓊脂糖凝膠(用電泳緩沖液配制)放入電泳槽內(nèi),加入待測(cè)樣品10μl,同時(shí)用分子量標(biāo)準(zhǔn)品作標(biāo)記。瓊脂糖濃度應(yīng)按分離DNA片段的大小進(jìn)行選擇,一般用1.5%~2%,電泳電壓75V,待樣品進(jìn)行凝膠內(nèi)距膠末端1cm時(shí),切斷電源,取出凝膠在紫外燈下直接觀察結(jié)果。
由于溴化乙錠可與雙鏈DNA形成結(jié)合物,在紫外燈下能發(fā)射熒光,使EB的熒光強(qiáng)度增強(qiáng)80~100倍,所以,電泳后凝膠在紫外燈下可直接觀察。一般肉眼觀察DNA量可達(dá)10ng,其熒光強(qiáng)度與DNA含量成正比。
DNA分子在凝膠中泳動(dòng)速度決定于電荷效應(yīng)及分子效應(yīng)。前者由所帶凈電荷量決定,而后者與分子大小及構(gòu)型有關(guān)。按照DNA分子大小,其凝膠濃度可做不同的調(diào)整。有條件的實(shí)驗(yàn)室也可用聚丙烯酰胺凝膠電泳(PAGE)分析擴(kuò)增的DNA片段。
表22-2 電泳檢測(cè)擴(kuò)增結(jié)果,EB熒光顯色(254nm)
瓊脂糖(%) | kb | PAGR(%) | bp |
0.3 | 60~5 | 3.5 | 100~1000 |
0.6 | 20~1 | ||
0.7 | 10~0.8 | 5.0 | 80~500 |
0.9 | 7~0.5 | 8.0 | 60~400 |
1.2 | 6~0.4 | 12.0 | 40~200 |
1.5 | 4~0.2 | 20.0 | 10~100 |