四、基本組織
由于DNA分子中核苷酸序列分析以及一級結構與功能相關的研究,使得人們有可能進一步了解DNA一級結構與基因組織的關系。已經(jīng)證實,自然界極大多數(shù)生物體遺傳信息貯存在DNA的核苷酸排列順序中,因此,基因是DNA的一個片段,只有少數(shù)病毒的遺傳信息貯存在RNA分子中。DNA分子中不同區(qū)域有不同功能,有些區(qū)域可編碼蛋白質(最終產(chǎn)物是蛋白質),有些區(qū)域可編碼RNA(最終產(chǎn)物是tRNA和rRNA),有些序列則與調(diào)控有關。那么一個DNA分子能攜帶多少基因呢?如果以平均1000個堿基對可編碼一個3kD的蛋白質計算,猴病毒(SV40)DNA分子量為3.0×105,有5000堿基對可編碼5種蛋白質。人染色體DNA有2.3×109堿基對,可編碼200萬以上的基因,但實際上,最多可編碼基因數(shù)為2~3萬。這是由于真核細胞DNA分子除編碼蛋白質和RNA等結構基因外,有相當部分DNA順序屬于非編碼區(qū),而原核細胞DNA由于分子較小,必需充分利用有限的核苷酸序列。各種生物體內(nèi)DNA分子的大小見表18-2。
表18-2 各種生物體內(nèi)DNA分子的大小
來源 |
分子量 |
堿基對數(shù)目 |
長度 |
噬菌體фX174 |
0.6μm | ||
腺病毒(SV40) |
1.6×106 |
4500 |
1.5μm |
鼠線粒體 |
3.0×106 |
14000 |
4.9μm |
噬菌體λ |
9.5×106 |
50000 |
17μm |
噬菌體T2或T4 |
3.3×107 |
200000 |
67μm |
大腸桿菌染色體 |
1.3×108 |
4500000 |
1.5μm |
人染色體 |
3.0×109 |
125000000 |
4.1μm |
1.真核生物的基因組織根據(jù)某一段核苷酸順序在整個DNA分子中出現(xiàn)的頻率不同可分為以下幾種:
(1)單拷貝順序(single copy sequence):在整個DNA分子中只出現(xiàn)一次或少數(shù)幾次,主要是編碼蛋白質的結構基因。除組蛋白、角蛋白和肌動蛋白以外,幾乎所有的蛋白質基因都是單拷貝順序,平均為1000堿基對。單拷貝基因在整個基因組織中所占比例最高。在人的細胞中約占DNA含量的一半。
。2)中等重復順序(moderately repetitive sequences):有些基因如核蛋白體RNA基因、tRNA基因、組蛋白基因等在DNA分子中可重復出現(xiàn)幾十到幾千次,約占人細胞DNA含量的30~40%。以rRNA為例,在大腸桿菌中重復頻率為7而果蠅中可重復千次?梢娬婧思毎兄貜晚樞虮仍思毎叩枚。
。3)高重復順序(highly repetitive sequences):可重復幾百萬次。往往是簡單的重復順序,如蟹的T-A-T-A-T-A-T。也有的較長如非洲綠猴DNA是以172個堿基對的順序為基礎重復幾萬次。高重復順序一般位于異染色質上,多數(shù)不編碼蛋白質或RNA,其功能還不太清楚,主要是起間隔作用,可能與調(diào)控有關。
在重復順序中還有一種反轉重復順序(inverted repetitive sequences)。其特點是一段堿基呈現(xiàn)回文結構,即一條單鏈回折即可形成互補的雙鏈,故稱為回文結構(palindromic structure)或發(fā)夾結構(hairpin structure)。這種結構對基因的復制與轉錄可能具有調(diào)節(jié) 控制功能。
真核細胞中單拷貝順序和重復順序常常是中間隔排列的。不僅如此,在一個基因內(nèi)部往往被一個或幾個額外的順序分割成若干片段,這種插入到基因內(nèi)部的順序稱為插入順序或內(nèi)含子(intron)。內(nèi)含子是不編碼的順序,而編碼的堿基順序則稱為外顯子(exon)。插入順序是真核細胞DNA最主要的特征。
真核生物由于存在著較多的重復順序、特殊的插入順序以及控制區(qū)和其它多余順序,使得DNA總長度往往大于編碼的結構基因,因此,實際基因數(shù)往往小于DNA分子。
2.原核生物的基因組織原核生物DNA分子較小,基因組織也較簡單,一般具有以下特點:
(1)DNA分子絕大部分用于編碼蛋白質,不編碼部分(又稱間隔區(qū))通常包含控制基因表達的順序。例如,噬菌體фX174中只有5%是非編碼區(qū)。
。2)功能相關的基因常常串聯(lián)在一起,并轉錄在同一個mRNA分子中,稱為多順序反子。這種現(xiàn)象在真核生物中是很少見的。
(3)基因重疊:例如фX174的E基因全部包括在D基因內(nèi),B基因則包括在查基因內(nèi)。這種現(xiàn)象主要發(fā)現(xiàn)在病理DNA分子中,可能是由于DNA分子太小又要裝入相當量的基因的緣故。